从血浆到组织：多种样本类型的DIA-MS分析解决方案
在蛋白质组学研究中，样本类型的复杂性和实验数据的可重复性往往难以兼顾。如何在血浆、组织、细胞和体液等多种生物样本中实现高通量、低偏倚的定量分析，是当前质谱技术持续优化的核心命题。数据独立采集质谱（Data-Independent Acquisition, DIA-MS）以其高覆盖率、良好重复性和缺失
翻译后修饰蛋白质组学：检测原理与富集策略解析
蛋白质翻译后修饰（Post-translational modifications, PTMs）是调控细胞功能的核心机制，广泛参与信号转导、细胞周期、代谢重编程等生物过程。系统研究PTMs的变化，对于揭示疾病机制和发现生物标志物具有重要意义。随着质谱技术的快速发展，翻译后修饰蛋白质组学（PTM pr
单细胞蛋白组如何高通量定量？TMT标记全攻略
细胞是生命活动的基本单元，然而即使同源细胞在相同环境中也可能呈现出显著的功能差异。这种细胞间异质性在癌症、免疫、发育等研究中被认为具有重要生物学意义。单细胞RNA测序近年来发展迅速，TMT标记（Tandem Mass Tag）成为单细胞蛋白质组定量中广泛采用的核心策略，凭借其高通量、多通道定量能力，
利用MALDI-TOF质谱技术进行蛋白质N-端序列分析
蛋白质的N-端序列分析是解析蛋白质功能、翻译后修饰及生物合成机制的重要手段。传统的Edman降解法是经典的N-端测序技术，但其在复杂样本中的应用受限。近年来，基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）以其高灵敏度、快速检测能力和宽动态范围，在蛋白质N-端序列分析方面展现出重要应用
如何利用LC-MS/MS提高C端测序的灵敏度和准确性？
在基于LC-MS/MS的C端测序中，灵敏度和准确性的提升需通过样品处理、仪器参数优化及数据分析策略的系统性协同改进。以下是关键优化方向： 1、选择合适的蛋白酶及样品制备策略 C端测序的关键在于获得高效、特异的C端肽段。常规酶（如胰蛋白酶）主要针对特定氨基酸切割，而非特异性酶（如蛋白酶K）或特定C端
如何通过蛋白全长测序验证复杂异构体的存在？5步操作指南
在蛋白表达系统中，即使来源于同一基因，所产生的蛋白质也可能因剪接变异、翻译起始差异、翻译后修饰或降解途径不同，形成多个结构相似但功能各异的蛋白质异构体（protein isoforms）。这些异构体广泛存在于天然蛋白中，尤其在抗体药物、融合蛋白及重组酶等生物制品开发过程中，其微小的结构差异可能对蛋白
为什么Edman降解仍然重要？探索其不可替代的应用场景
在质谱技术主导蛋白质组学的时代，Edman降解似乎成了“过去式”。但事实并非如此。作为一种经典且精准的N端蛋白质测序方法，Edman降解在多个关键场景中依然有着不可替代的价值，尤其是在蛋白质结构验证、药物质量控制以及非模式生物的研究中。本文将深入解析Edman降解的原理与优势
De Novo测序和同源性搜索，如何协同分析？
在蛋白组学研究中，数据库搜索（Database Search）仍是主流分析方式，但它高度依赖现有数据库的完整性与准确性。当我们面对的是非模式生物、天然产物、抗体片段或翻译起始位点变异的肽段时，数据库可能无法匹配这些“新序列”，导致错配或完全漏报。 这时，De Novo测序（
数据偏差让蛋白鉴定结果 “打水漂”？这几个先进方法快码住
在蛋白质组学研究中，数据偏差是导致蛋白鉴定结果不准确、不稳定的主要原因之一。无论是样品制备、实验过程，还是数据分析，每个环节的偏差都会影响最终的蛋白鉴定结果，甚至让数据“打水漂”。本文将深入解析蛋白鉴定中常见的数据偏差类型，并提供最先进的纠偏策略，确保实验数据精准可靠！ 一
如何通过Edman降解实现高效蛋白质序列分析？实验室指南
Edman降解是一种经典且高度特异的蛋白质N端序列分析技术，至今仍在结构蛋白质组学、抗体工程与生物药研发中扮演着重要角色。尽管高分辨率质谱技术日新月异，Edman降解因其对N端氨基酸的逐步解析能力，在某些特定应用场景中仍具有不可替代的价值。本文将从实验原理、操作流程、样本准备、结果解析及常见问题出发